dNTPs是PCR反应最主要的试剂之一，也是PCR包含的七种基本成分之一。高质量的脱氧核糖核苷酸 (dNTPs) 对 PCR 、 RT-PCR 、测序和标记等反应的成功都非常重要，标准PCR反应体系中包含4种等摩尔浓度的脱氧核苷三磷酸，既dATP、dTTP、dCTP和dGTP。

如果四种脱氧核糖核苷酸的浓度不一致，将大大增加聚合酶的错配机率；如果纯度不高，或者混有甲基化的脱氧核糖核苷酸将造成产物的甲基化；或者含有脱氧核糖核苷一磷酸、脱氧核糖核苷二磷酸也会降低聚合酶的聚合能力。

选择好的dNTP对PCR实验至关重要。

PCR反应时应该注意的有：

在Taq DNA聚合酶反应液中包含1.5mmol/L MgCl₂条件下，每种dNTPs的浓度一般在200~250umol/L之间。在50ul反应体系中，这种dNTP浓度应该能够合成6~6.5ug的靶基因DNA；这种靶基因的合成量即使在八对甚至超过八对引物同时进行多重PCR扩增反应也能够满足其要求了。高浓度的dNTP(>4mmol/L)对扩增反应起抑制作用，也许是因为dNTP与镁离子螯合而引起的效应。然而，如扩增片段在约1KB长度，每种dNTP浓度控制在20umol/L至0.5~1.0pmol/L，可能会使扩增产物获得满意的产率。

市场上有专门用于PCR的dNTP原液，这些dNTP原液除去了可能抑制PCR的磷酸盐；用NaOH调整pH至8:1；碱性环境在某种程度上可防止原液在冷冻与融化时损坏dNTP分子结构。为了避免这类问题，dNTP原液（100~200mmol/L）购买后最好分成小份，储藏在-20摄氏度的冰箱中，避免反复冻融。在零下20度的长期保存期间，少量的水分会蒸发，然后凝结在小管壁上。为了减少浓度的改变，含dNTP溶液的小管在融化后应在离心机上离心几分钟，是管壁上的液体回落到管中。