描述:
识别位点:

在不同反应缓冲液的活性
NEBuffer 1:NR%
NEBuffer 2:NR%
NEBuffer 3:NR%
NEBuffer 4:100%
概述
FspEI 是修饰依赖型内切酶,经过 EpiMark™ 验证,能识别 CmC 位点,其切割位点在距离带有修饰的胞嘧啶以外 3´端 N12/N16 处切割。可识别的胞嘧啶修饰包括:5-甲基胞嘧啶(5-mC)和 5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)(1)。
在真核生物中最常见的表观遗传修饰是位于 CpG 或 CHG 位点上的甲基化修饰。这一系列的修饰位点均可以被 FspEI 识别和切割。
完全甲基化的 CpG 位点:
5´…CCmGG…3´
3´…GGmCC…5´
或 CHG 位点:
5´…CmCHGG…3´
3´…GGDmCC…5´
H = A 或 C 或 T(不是 G)
D = A 或 G 或 T(不是 C)
FspEI 识别每一个半甲基化位点,分别双向切割产生 32 碱基或 31 碱基的片段。这些片段含有核心甲基化位点,并在每一个片段的 5´末端有一个 4 碱基突出。FspEI 不切割未修饰的 DNA。
来源:重组 E. coli 菌株,含有从 Frankia species EAN1pec 合成的 FspEI 基因。
贮存条件:300 mM NaCl,10 Mm Tris-HCl(pH 7.4 @ 25℃),0.1 mM EDTA,1 mM DTT,
200 μg/ml BSA 和 50%甘油。
随酶提供试剂:10X NEBuffer 4,100X BSA。
反应条件:1X NEBuffer 4,加入 BSA,37℃温育。
1X NEBuffer 4:50 mM KAc, 20 mM Tris-Ac, 10 mM Mg(Ac)2, 1 mM DTT, pH 7.9 @ 25℃。
单位定义:1 单位指 50 μl 反应体系中,37℃条件下 16 小时完全消化 1 μg pBR322(dcm+)DNA 所需的酶量。
稀释兼容性:稀释液 B。
300 mM NaCl,10 mM Tris-HCl,0.1 mM EDTA,1 mM DTT,500 μg /ml BSA ,50%甘油
(pH 7.4 @ 25℃)。
质量控制检测
质量保证:EpiMark 系列产品已经广泛应用于表观遗传学研究。
基因组 DNA 酶切步骤:
1. 在无菌离心管中依次加入以下试剂(注意:FspEI 要最后加入到反应中):
DNA(0.5-1 μg) 1-5 μl
10X NEBuffer 4 3 μl
BSA 1 μl
FspEI 0.5-1 μl(2-4 units)
灭菌双蒸水 至 30 μl
2. 37℃温育 4-16 小时。
16 小时温育:50 μl 反应体系中,20 单位酶与 1 μg 未经修饰的底物 DNA [pBR322(dcm-)] 温育 16 小时,琼脂糖凝胶电泳未显示有非特异性核酸酶产生的 DNA 条带。
核酸外切酶活性:50 μl 反应体系中,20 单位酶与 1 μg 单双链混合 3H 标记的 E.coli DNA
(105 cpm/μg)于 37℃温于 4 小时,释放小于 0.1%的放射性物质。
RNase 检测:10 μl 反应体系中,20 单位酶与 40 ng RNA 转录产物于 37℃过夜温育,琼脂糖凝胶未检测到 RNA 降解。
酶的存活性:16 小时消化 1 μg 底物 DNA 至少需 0.16 单位的酶量。
热失活:65℃ 20 分钟。