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FspEI

 
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描述:

识别位点:

在不同反应缓冲液的活性

NEBuffer 1:NR%

NEBuffer 2:NR%

NEBuffer 3:NR%

NEBuffer 4:100%

概述

FspEI 是修饰依赖型内切酶,经过 EpiMark™ 验证,能识别 CmC 位点,其切割位点在距离带有修饰的胞嘧啶以外 3´端 N12/N16 处切割。可识别的胞嘧啶修饰包括:5-甲基胞嘧啶(5-mC)和 5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)(1)。


在真核生物中最常见的表观遗传修饰是位于 CpG 或 CHG 位点上的甲基化修饰。这一系列的修饰位点均可以被 FspEI 识别和切割。

 

完全甲基化的 CpG 位点:
5´…CCmGG…3´
3´…GGmCC…5´

 

或 CHG 位点:
5´…CmCHGG…3´
3´…GGDmCC…5´

 

H = A 或 C 或 T(不是 G)
D = A 或 G 或 T(不是 C)

 

FspEI 识别每一个半甲基化位点,分别双向切割产生 32 碱基或 31 碱基的片段。这些片段含有核心甲基化位点,并在每一个片段的 5´末端有一个 4 碱基突出。FspEI 不切割未修饰的 DNA。

 

来源:重组 E. coli 菌株,含有从 Frankia species EAN1pec 合成的 FspEI 基因。

 

贮存条件:300 mM NaCl,10 Mm Tris-HCl(pH 7.4 @ 25℃),0.1 mM EDTA,1 mM DTT,

200 μg/ml BSA 和 50%甘油。

 

随酶提供试剂:10X NEBuffer 4,100X BSA。
 

反应条件:1X NEBuffer 4,加入 BSA,37℃温育。
1X NEBuffer 450 mM KAc, 20 mM Tris-Ac, 10 mM Mg(Ac)2, 1 mM DTT, pH 7.9 @ 25℃。

 

单位定义:1 单位指 50 μl 反应体系中,37℃条件下 16 小时完全消化 1 μg pBR322(dcm+)DNA 所需的酶量。

 

稀释兼容性:稀释液 B。
300 mM NaCl,10 mM Tris-HCl,0.1 mM EDTA,1 mM DTT,500 μg /ml BSA ,50%甘油

(pH 7.4 @ 25℃)。

质量控制检测

质量保证:EpiMark 系列产品已经广泛应用于表观遗传学研究。

 

基因组 DNA 酶切步骤:
1. 在无菌离心管中依次加入以下试剂(注意:FspEI 要最后加入到反应中):
DNA(0.5-1 μg) 1-5 μl
10X NEBuffer 4 3 μl
BSA 1 μl
FspEI 0.5-1 μl(2-4 units)
灭菌双蒸水 至 30 μl 
2. 37℃温育 4-16 小时。

 

16 小时温育:50 μl 反应体系中,20 单位酶与 1 μg 未经修饰的底物 DNA [pBR322(dcm-)] 温育 16 小时,琼脂糖凝胶电泳未显示有非特异性核酸酶产生的 DNA 条带。

 

核酸外切酶活性:50 μl 反应体系中,20 单位酶与 1 μg 单双链混合 3H 标记的 E.coli DNA

(105 cpm/μg)于 37℃温于 4 小时,释放小于 0.1%的放射性物质。

 

RNase 检测:10 μl 反应体系中,20 单位酶与 40 ng RNA 转录产物于 37℃过夜温育,琼脂糖凝胶未检测到 RNA 降解。

 

酶的存活性:16 小时消化 1 μg 底物 DNA 至少需 0.16 单位的酶量。

 

热失活:65℃ 20 分钟。

 

 


注意事项:

过量使用该酶会抑制切割反应。根据不同底物,优化酶量已达到最佳酶切效果,延长温育时间降低酶量也可以达到完全酶切 DNA 的效果。FspEI 可以在37℃稳定 16 小时以上。


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说明书

参考文献

本产品可用于的实验

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