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PCR-SSP(sequence specific primer )即序列特异引物引导的PCR反应。序列特异性引物是根据不同类型核心序列关键几处碱基的差异而设计。特异性引物仅从对应类型的核心序列起始扩增,而不与其他核心序列退火。由于该型核心序列是串联重复形式,引物可以与每一个核心序列结合,串联重复数不同的同一种核心序列距公共引物的距离不同,由此可以产生出大小不同的阶梯状扩增片段。这些PCR产物经电泳分离,银染显示呈现为不同的阶梯状扩增片段图谱。
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