变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)

变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)分析PCR产物，如果突变发生在最先解链的DNA区域，检出率可达100％，检测片段可达1kb，最适围为100bp-500bp。变性梯度凝胶电泳法原理基于当双链DNA在变性梯度凝胶电泳中进行到与DNA变性温度一致的凝胶位置时，DNA发生部分解链，电泳迁移率下降，当解链的DNA链中有一个碱基改变时，会在不同的时间发生解链，因影响电泳速度变化的程度而被分离。由于变性梯度凝胶电泳法是利用温度和梯度凝胶迁移率来检测，需要一套专用的电泳装置，合成的PCR引物最好在5`末端加一段40bp-50bp的GC夹，以利于检测发生于高熔点区的突变。

DGGE变性梯度凝胶电泳主要应用于环境样品细菌、古细菌、真菌、真核微生物的多样性分析（土壤、水等样品无需培养，直接提取DNA扩增检测）动、植物体内外共生微生物的检测；食品微生物的检测；医学领域碱基突变的检测，杂合子检测等等。