用于琼脂糖凝胶中DNA的定性及定量的染料，在紫外成像仪下DNA条带呈现，便于肉眼观察和软件分析。

作用原理：染料会嵌入到堆积的碱基对之间并拉长线状和带缺口的环状DNA，使其刚性更强；有的染料作用于单链DNA，有的可作用于双链或环状DNA。

常见的DNA染料有EB、SYBR Green系列、Goldview、Genefinder、UltraPower、GelRed和GelGreen、甲基绿、PI等。